shell脚本基本命令
1、在shell脚本中可以使用三类命令： 1)Unix 命令： 虽然在shell脚本中可以使用任意的unix命令，但是还是由一些相对更常用的命令。这些命令通常是用来进行文件和文字操作的。
2、f表示指定小数可以保留两个小数位，要注意的是4并不代表整数部分的位数，也不代表整数位和小数位的和。注意：使用echo和printf的命令选项时，要保证选项出现在命令行内所有字符串之前，否者Bash会将选项视为另一个字符串。
3、shell脚本中判断上一个命令是否执行成功shell中使用符号“$？”来显示上一条命令执行的返回值，如果为0则代表执行成功，其他表示失败。结合if-else语句实现判断上一个命令是否执行成功。
LINUX快速入门第八章:Shell基础
Bash Shell 是 GNU 计划的重要工具之一，也是 GNU 系统中标准的 Shell。Bash 与 sh 兼容，所以许多早期开发出来的 Bourne Shell 程序都可以继续在 Bash 中运行。现在使用的 Linux 就使用 Bash 作为用户的基本 Shell。
Shell基础：你可以通过打开Linux的terminal（终端）来执行Shell命令。Shell的种类有很多种，例如CSH，Bourne Shell，Korn Shell。在现在的大多数Linux发行版中，默认的Shell一般都是Bourne again shell(bash)。
*** 一：通过系统自带的检索系统，我们可以轻松找到终端(Terminal)，单击即可打开。检索系统可以通过快速启动栏右上角的按钮启动。 *** 二：为了之后可以方便的打开终端，建议将终端固定在快速启动栏。
LINUX快速入门第八章：Shell基础之一种：Bourne shell Bourne shell又包括Bourne shell (sh)、Korn shell (ksh)、Bourne Again Shell(bash)三种类型。
Linux命令基础操作Shell的简介Linux系统中由内核，Shell，文件系统和一些实用的程序构造。Shell是操作系统提供给用户使用的界面它提供了用户与内核进行交互操作的一种接口。
linuxshell编程
在开始Shell编程之前shell脚本入门菜鸟，shell脚本入门菜鸟我们需要设置好开发环境。首先shell脚本入门菜鸟，我们需要打开终端窗口，这可以通过在桌面上单击终端图标或使用快捷键Ctrl+Alt+T来实现。
可以这样做shell脚本入门菜鸟： *** 1：sed -i s/被替换的内容/要替换成的内容/ file *** 2：sed s/被替换的内容/要替换成的内容/g file file.outshell脚本入门菜鸟；mv file.out file。
连接上相应的linux主机，进入到等待输入shell指令的linux命令行状态下。在linux命令行下输入shell指令：vi test.shell。最后，按下回车键执行shell指令，此时发现用vi命令成功进入了shell编程模式中。
沿着前面的轨迹，接下来是Linux中shell脚本的学习。这对于生信工程师后续处理大量 (海量更合适些) 数据是非常非常重要的，但是同样的，作为一个有点古板的人，对于脚本是什么意思我都死磕了好久。
shell编程属于脚本编程，脚本文件就是指令的 *** ，GCC是GNU编译系统驱动程序。Linux中的库分两种：静态库和共享库。
$1表示第几个参数
1、bash$ list.sh -sh --debug /home/user。脚本中$0的值就是list.sh，$1的值是-sh，$2的值是--debug，$3的值是/home/user。0 这个程式的执行名字。n 这个程式的第n个参数值，n=.9。
2、这个是 SHELL 语句，其中：ROOTFS_DIR 表示 SHELL 变量；$1 表示命令行参数的第二个参数。例如：如果你在 SHELL 提示符 $ 下输入一个命令行：cat file1；那么 $0 就是 cat；$1 就是 file1。望采纳。
3、if[x$1 = x]；中$1表示运行shell时传的之一个参数。即：如果有一个shell文件名为test.sh那么运行命令为 ./test.sh a b 其中a为之一个参数b为第二个参数$1就代表的是a这个字母。
4、表示运行该脚本时的之一个命令行参数 {1##*.tar.} 表示之一个命令行参数去掉*.tar.后剩下的部分。
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